Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms