Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms