Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700109H08RikQ9D9C0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms