Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms