Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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