Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl40Q9D783 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms