Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms