Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms