Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zc2hc1bQ9D534 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms