Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc83Q9D4V3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms