Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcc1Q9D4H2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms