Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Krt20Q9D312 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Krt20Q9D312 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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