Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms