Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms