Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mms19Q9D071 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms