Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms