Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrs1Q9CYH6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms