Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms