Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nip7Q9CXK8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nip7Q9CXK8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms