Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms