Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms