Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PclafQ9CQX4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms