Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms