Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms