Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms