Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms