Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms