Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms