Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q922R1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q922R1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q922R1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q922R1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q922R1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms