Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms