Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Afg3l1Q920A7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms