Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm2Q91YD4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms