Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac11Q91WA3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac11Q91WA3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms