Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mark1Q8VHJ5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms