Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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