Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms