Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BbxQ8VBW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms