Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolbQ8K409 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms