Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms