Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Nek9Q8K1R7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Nek9Q8K1R7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Nek9Q8K1R7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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