Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnppd1Q8K158 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms