Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl11Q8CE33 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl11Q8CE33 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms