Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc9Q8CDN9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms