Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms