Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Uba3Q8C878 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Uba3Q8C878 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Uba3Q8C878 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba3Q8C878 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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