Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C5C9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C5C9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms