Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms