Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms