Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx16Q8C080 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms