Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms